Ich habe das Problem jetzt selber gelöst:
Auf den Festplatten muss der Jumper 7-8 gechlossen werden, damit die Advanced Format Technology der Festplatte aktiviert wird.
DiskStation> fdisk -l -u
Disk /dev/sda: 1000.2 GB, 1000204886016 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 121601 cylinders, total...