Bei vielen kleineren Dateien sinkt die Geschwindigkeit. Deshalb der Test mit einer großen Datei, die in einem Stück übertragen werden kann.
Hast du mal in der Fritzbox überprüft, ob der LAN-Port, an dem das NAS hängt, auf 1 GBit eingestellt ist? Standardmäßig sind die glaube ich auf Green-Mode...