Ich nehme an du meinst deine "Audio Station". Ich hatte auch schon mal 2 Alben auf der NAS. Habe eines gelöscht dann war es wieder weg.
1) Du kannst auf dem Webinterface schauen ob du doppelt Dateien hast. Song markieren und oben Rechts => Action=> Song informationen. Dort hast du den Pfad der mp3, flac usw.
2) Sollten beide auf die gleiche Datei verweisen dann kannst du den Index neu bilden. (Systemsteuerung, Index Service)