Wenn Du vorher eine DSM-4.x laufen hattest, dann dürften jetzt Zugriffsrechte nicht mehr passen.
Mit dem Wechsel auf DSM-5.0 hat Synology einige Änderungen vorgenommen - eine davon ist, dass der User-Webserver jetzt nicht mehr unter dem User "nobody" läuft (bis zu DSM-4.x), sondern unter dem neuen User "http" der Gruppe "http". Warum erzähle ich das? Weil Pakete wie ownCloud auch über diesen Webserver laufen. Damit das funktioniert, benötigt also "http" Zugriffsrechte auf die Ordner der ownCloud-Installation.
Hinweis: Du verwendest eine recht alte Version von ownCloud. Vielleicht wäre es an der Zeit, hier auch auf die aktuelle Version umzusteigen - dieses ist die Version 7.0.1.
Hier und
hier findest Du dazu einige Informationen.