Es geht darum, das auf Dateiebene, also die Dateien, die tatsächlich auf Deiner Festplatte liegen, mittels irgendeinem SyncTool zu synchronisieren.
Du kannst sie jedoch auf den NAS schieben, und dann von dort aus öffnen. OneNote weiß dann, dass das Notizbuch auf einem entfernten Laufwerk liegt...