Wenn alles richtig installiert ist und alle Rechte entsprechend vergeben sind, dürften keine Konflikte auftreten. Die Erfahrung zeigt, daß nach dem Abgleich vor Ort, geringe Ordner- und Dateimengen trotzdem wieder ausgetauscht werden, wenn der Server in einem anderen Netzwerk aufgestellt wird.
Allerdings, und da verweise ich auf
http://www.synology-forum.de/showthread.html?73121-Cloudstation-4-in-DSM-6-Beta-2 ist die Cloudstation meiner Ansicht nach seit jeher problembehaftet. Auch die neue Version 4 ist im Grunde nur für kleine Ordnerstrukturen zu gebrauchen.
Ich habe auf meinem Produktivsystem rund 40 Ordner mit insgesamt ca. 1000 GB zu synchronisieren und habe ca. 600 km entfernt eine weitere stehen, als Backup und um switchen zu können. Alle wesntlichen Freigabeordner werden mit dieser synchronisiert, wobei ich dafür BTsync verwende.
Ich wollte ursprünglich mal Cloudstation für diesen Zwecke einsetzen, da wars noch Version 2, aber ich habe schnell gemerkt, daß es eine Katastrophe ist damit. Die damaligen BTsync-Versionen waren auch noch nicht sauber, dagegen die heutigen 2.2.5-er oder 2.2.7-er sind echt super. Die kannst Du laufen lassen und "vergessen". Dagegen, um Cloudstation mußt Du Dich irgendwie kümmern. Du hast das Gefühl, es läuft nicht rund - tuts auch im Grunde nicht.
Ich habe noch Syncthing im Test. Die Version 0.12.19 ist nun soweit, daß sie an BTsync schnuppern kann. Wenn man sauber auf Besitzer- und Ordnerrechte achtet, läuft auch das. Allerdings, im grossen Stil habe ich das nicht im Einsatz, wie BTsync, von daher ist meine Aussage dazu nicht ganz repräsentativ.