Um auf die Anfangsfrage zurückzukommen:
Den Fehler hatte ich beim Erstellen des Let's Encrypt Zertifikates auch, obwohl Port 80 und 443 auf die Synology gelietet wurden.
Die Lösung war bei mir
nicht den ausgegrauten Beispielen in den 3 Textfeldern für Domainname, Email und Betreff Alternativer Name zu folgen.
Dort steht:
Domainname: example.com
Email: admi(at)example.com
Betreff Alternativer Domainname: mail.example.com
Ich habe bei Domainname die komplette Domain mit Subdomain eingetragen. Und zusätzlich (was nicht jeder brauchen wird) für eine 2. Synology mit extra Subdomain im unteren Feld die 2. volle Domain mit Subdomain eingetragen.
Und es hat sofort funktioniert. - Zertifikat dann exprtiert und auf der 2. Synology imoprtiert. - Funktioniert super; ein Zertifikat für 2 Domains und 2 Synologys.
Lösung:
Domainname: subdomain.example.com
Email: admin(at)example.com
Betreff Alternativer Domainname: subdomain2.example.com
Vielleicht haben einige wie ich dem Beispiel gefolgt und im ersten Feld nur die Domain eingetragen. Was leider nicht ausreicht.