So ein ähnliches (oder dasselbe) Problem hab ich hier im Forum schon einmal gelesen und dachte eigentlich, dass es mit der neusten Firmware nicht mehr auftritt. Irgendwie klingelt noch was im Gedächtnis ... irgendeine Einstellung, mit der man es halbwegs beheben konnte ... vielleicht findest ja noch was per Suchfunktion dazu. Ansonsten schreib dem Synology-Supprt eine E-Mail und schildere dein Problem. Die sollten das Problem endlich in den Griff bekommen, so dass man kopieren kann, ohne dass man Expertenwissen dazu braucht.
Grundsätzlich gibt es auch so Limits unter Windows wie 255 Zeichen darf ein Dateiname maximal lang sein und 1023 darf ein Pfad maximal lang sein ... ich hoffen mal, dass du jetzt nicht sowas gemacht hast.
Itari