Ich habe das gleiche Problem mit 3.2 und auch schon an Synology gemeldet.
WD40000H2Q: 2x2TB als RAID0, gibt sich als 4TB aus, partitioniert als GPT
Hat USB, Firewire und eSATA.
Mit USB hat die Diskstation kein Problem, eSATA wird nur einmal erkannt (nach dem Booten).